東巴文化博物館以東巴文化為特色，占地7畝，包括歷史、自然、藝術在內的綜合性民族民俗博物館。博物館主體建筑形式為仿古納西族四合院式，根據地形地貌，充分利用山水環境條件，形成以群體院落作為主體建筑帶的古建筑。
麗江納西東巴文化博物館建筑按納西族民居的發展進行布局，利用玉泉水源和象山西麓的自然景觀，由北向南開辟了古人類洞穴居、巢居、半穴居、帳篷居、干欄居以及木楞房、三坊一照壁、四臺五天井等不同階段的傳統民居，并在其中展出反映各時期納西族生產力水平的民俗文物資料。