羊八井寺，是西藏佛教噶瑪噶舉紅帽系的主寺。噶舉紅帽系的主寺。噶瑪噶舉是塔布噶舉傳出的四大支系之一，它的創始人是塔布拉杰（1079-1153）的門徒都松欽巴（1110-1193）。噶瑪噶舉又分兩個小支系：一個是黑帽系，因噶瑪拔希（1204-1283）得到元憲宗賞賜的金邊黑色僧帽而得名；一個是紅帽系，是從黑帽系中派生出來的，因為他的一世活佛扎巴僧格得到元朝皇室成員賜給一頂紅色僧帽而得名。俗稱“紅帽派”，漢文作“沙瑪爾巴”。扎巴僧格（1283-1349）是黑帽系第三世活佛讓瓊多杰的弟子，他除噶舉外，還學習噶當（創始人為仲敦巴·嘉瓦迥乃）、覺囊（創始人為宇摩·彌覺多杰）等教派的教法，于1333年建立了乃朗寺，在未建立羊八井寺之前乃朗寺一直是紅帽系的主寺。紅帽系共傳十輩，歷時四百年。第二世活佛名喀覺旺波（1350-1405），建有達孜南嘉嶺寺和噶瑪摩寺，是一位飽學多識的高僧；第三世活佛名卻貝益西（1406-1452），曾得到明朝皇帝賜給的封號以及佛像、法器等物品。

    羊八井寺從紅帽系第四世活佛卻扎益西于1490年興建，到1791年停止轉世的三個世紀中，陸續增修擴建，形成一座規模宏大的寺廟建筑群。寺內文物很多，由于得到仁蚌巴·敦悅多杰地方勢力和藏巴汗地方政權的資助，寺院資產也極為可觀。據1791年清朝駐藏大臣查抄清點的結果，羊八井寺共有房屋1135間（其中樓房778間、僧房357間）、常住僧人103人、莊園9處。另外，僅羊八井寺紅帽系活佛家里私藏的僧衣、幔帳、金銀、銅鐵器皿及婦女首飾等價值兩千余金。其中尚有“灌頂國師”鍍金銅印一顆，系“元明故物”，據說已“送京銷毀”。羊八井寺經過這次查抄，寺產被充公，寺院賜給平定廓爾喀有功的功德林濟嚨呼圖克圖活佛管理，僧人被改宗格魯派，寺廟才得以存留下來。

    羊八井寺在“文革”時被毀。黨的十一屆三中全會以膈，逐步落實了黨的民族宗教政策，于1985年政府撥款進行了修復。